Исследователи из Института AIRI, НИУ ВШЭ и Constructor University (Германия) представили на конференции ICLR Open Source — бенчмарк GeomMotif, позволяющий выявлять ошибки моделей ИИ при генерации 3D-структур молекул белков.

GeomMotif состоит из 57 задач, выстроенных по нарастанию сложности. Модель получает один или два мотива (группы небольших последовательностей нуклеотидов), для которых должна достроить белковые молекулы. Ученые подчеркивают, что при таком подходе оценивается не только общий уровень модели, но то, на каком этапе она начинает ошибаться.

Тестирование ряда моделей на бенчмарке показало, что лучше с задачами бенчмарка справляются решения, работающие с 3D-структурой белка, а не предсказывающие ее на основе генерации последовательностей аминокислот.

В апреле 2026 года исследователи из НИУ ВШЭ представили ИИ-систему GSMFormer-PPI для прогнозирования взаимодействия белков.